Ribosomenassozierte Qualitätskontrolle in Therapieresistenz in AML

Ribo-Seq ist eine Next-Generation-Sequenzierungstechnik zur globalen Kartierung der Ribosomenposition auf mRNA-Molekülen und ermöglicht so Einblicke in die aktive Translation. Durch die Analyse ribosomengeschützter mRNA-Fragmente lassen sich codonspezifische Translationsraten bestimmen und aktiv translatierte mRNA-Regionen identifizieren. Darüber hinaus können Regionen mit erhöhtem ribosomalem Stopping oder Readthrough identifiziert werden. Basierend auf unseren Erkenntnissen, dass die Behandlung mit Menin-Inhibitoren Translations-Readthrough induziert und der Knockout von ABCF2, einem Gen, das an der ribosomenassoziierten Qualitätskontrolle (RQC) beteiligt ist, Resistenzen gegen Menin-Inhibitoren hervorruft, schlagen wir vor, Ribo-Seq in MOLM-13-AML-Zellen nach Menin-Inhibitor-Behandlung durchzuführen, um sequenzspezifische, medikamenteninduzierte Veränderungen der Translationseffizienz präzise zu bestimmen. Des Weiteren werden wir Ribo-Seq-Analysen in Wildtyp- und ABCF2-defizienten MOLM-13-AML-Zellen durchführen, um zu ermitteln, wie ABCF2 die effiziente Translation spezifischer Transkripte beeinflusst und ob der Verlust von ABCF2 zu Veränderungen in der Häufigkeit blockierter Ribosomen führt. Die Identifizierung differentiell translatierter mRNAs wird zur Identifizierung von Genen führen, die die Reaktion von AML-Zellen auf Menin-Inhibitoren vermitteln könnten. Da Ribo-Seq eine nicht-standardisierte experimentelle Methode ist, ist eine praktische Schulung in allen Ribo-Seq-Protokollen sowie in der Datenanalyse unerlässlich, um diese Experimente erfolgreich durchzuführen und auszuwerten. Daher eignet sich dieses Projekt aufgrund seines Bedarfs an Austausch spezifischer Expertise und Schulung in nicht-standardisierten Methoden zur Beantwortung einer wichtigen Frage im Bereich der Leukämiebiologie ideal für das EHA-Forschungsmobilitätsstipendium. Insgesamt wird dieses Projekt erstmals untersuchen, wie zielgerichtete Therapien die Translation und die RQC beeinflussen, ein Bereich, der bisher völlig unerforscht ist. Die Ergebnisse dieser Arbeit könnten zur Entwicklung neuartiger Kombinationsansätze führen, einschließlich Menin-Inhibitoren, und ABCF2 als prädiktiven Biomarker für die Wirksamkeit von Menin-Inhibitoren bei AML-Patienten etablieren.

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